Il laboratorio europeo di biologia molecolare (EMBL) ha messo a disposizione una risorsa gratuita on line denominata CiteXplore che collega la letteratura scientifica alle banche dati scientifiche.

Secondo gli sviluppatori di CiteXplore, nelle scienze biologiche si avvertiva da molto tempo la necessità di uno strumento che integrasse gli articoli delle riviste scientifiche con le banche dati contenenti informazioni biologiche quali sequenze di DNA e proteiche, funzioni e strutture delle molecole e dati di microarray.

«Consultando l'estratto di un articolo che descrive un gene o una proteina specifici, in genere si desiderano sia maggiori informazioni in merito, per esempio la sequenza o la funzione, sia un accesso agevole all'articolo completo», ha spiegato Peter Stoehr, coordinatore di CiteXplore.

CiteXplore, sviluppato dall'Istituto europeo di bioinformatica (EBI) dell'EMBL, riunisce estratti di varie banche dati di letteratura, compreso l'Ufficio europeo dei brevetti, la banca dati MEDLINE della biblioteca nazionale di medicina degli Stati Uniti e l'Accademia delle scienze cinese, e stabilisce un collegamento con il testo completo degli articoli.

Un potente strumento di ricerca testuale individua i termini biologici nel testo collegandoli direttamente alla voce pertinente nelle ampie banche dati biologiche dell'EBI, tra cui la Nucleotide Sequence Database dell'EMBL, contenente sequenze di DNA e RNA, la UniProt, che racchiude informazioni sulla struttura e la funzione delle proteine e la ArrayExpress, che raccoglie informazioni sulle modalità di espressione dei geni.

CiteXplore intende ampliare la gamma di risorse letterarie, inserendo settori quali la scienza vegetale e la scienza agroalimentare e integrandoli con PubMedCentral, progetto britannico recentemente avviato.

L'EBI è il principale divulgatore di informazioni biologiche in Europa e il Forum strategico europeo sulle infrastrutture di ricerca ha recentemente messo in luce tale aspetto nella sua tabella di marcia.